石墨粉虽然运用广泛，但长期吸入石墨粉尘会引起石墨尘肺病,石墨尘肺是指长时间吸入较高浓度的石墨生产粉尘而引起的以肺部病变为主的全身性疾病。石墨粉尘无化学腐蚀性对人体皮肤无危害而且容易清洗,使用肥皂洗涤即可去除。
加工中心自身的密封性能好,关闭防护门可有效防止粉尘逸出。
石墨粉尘对机床和刀具的使用寿命和加工精度有很大影响。
（一）、石墨粉尘对机床、刀具和工人的影响
石墨电极材料具有质软、导热导电性能好、耐高温等优点，被广泛应用，以模具行业为例，石墨因其具有电极消耗小、加工速度快、耐温高、加工精度高等优点，逐渐代替铜电极成为加工电极的主流，在加工方法上除了普通的机械加工外，高精度、高效率的高速加工技术也在石墨加工中广泛应用，与此对应的，用于石墨加工的工具除了普通机床、加工中心外，针对石墨的特点而设计石墨高速加工中心也日益受到青睐。
（二）、机床的防尘与除尘
石墨粉尘对人体健康同样有影响,长期长期吸入石墨粉尘会引起石墨尘肺病。对位于工作台下的传动系统,很难采取完全密封防尘,可在其附近加装集尘管。石墨粉尘若进入主轴则会造成装夹不稳,缩短刀具寿命,增大加工表面粗糙度,增加停机时间,降低工件加工尺寸精度和主轴轴承使用寿命。